Ethan Hunt og IMF-holdet fortsætter deres søgen efter den skræmmende AI, kendt som "The Entity", der har infiltreret efterretningsnetværk over hele kloden. De bliver jaget af alverdens regeringer og et mystisk spøgelse fra Ethans fortid. Hunt er i et kapløb med tiden for at forhindre, at verden, som vi kender den, ændrer sig for altid.